<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
<head>
  <meta content="text/html;charset=UTF-8" http-equiv="Content-Type">
</head>
<body bgcolor="#ffffff" text="#000000">
For what it's worth, I agree with Kevin on this.  The TDWG domain has
been hosted by different organisations at different times and it seems
a natural place for such a resolver.<br>
<br>
Donald<br>
<br>
Kevin Richards wrote:
<blockquote
 cite="mid:20071203T082803Z_6007000B0000@landcareresearch.co.nz"
 type="cite">
  <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; ">
  <meta content="MSHTML 6.00.5730.11" name="GENERATOR">
  <div>I think this is the idea of "communities".  I.e. nothing is
guaranteed to be forever.  It relies on us as a community to keep it
going indefinitely.  So yes on the safe side, we could say "in the
forseeable future", but on the idealistic side we would say
"indefinitely".  </div>
  <div> </div>
  <div>So I would reccommend staying with tdwg.org, as this ties the
"domain" to a global community / an ideal / an aspiration, rather than
to a commercial / funding based organisation (which could, even more
readily, be terminated).</div>
  <div> </div>
  <div>Any "infrastrutcture" will need to be housed somewhere and, I
guess, this will be up to the members of our community to chip in and
provide the services required at the time (as GBIF have done recently).</div>
  <div> </div>
  <div>This probably all sounds a bit "idealistic", but I think ideals
last longer than organisations, and longer than any specific technology
for that matter (LSIDs, DNS, Internet, etc).</div>
  <div> </div>
  <div>Kevin<br>
  <br>
&gt;&gt;&gt; "Chuck Miller" <a class="moz-txt-link-rfc2396E" href="mailto:Chuck.Miller@mobot.org">&lt;Chuck.Miller@mobot.org&gt;</a> 1/12/2007
6:18 a.m. &gt;&gt;&gt;<br>
  </div>
  <div style="color: rgb(0, 0, 0);">How to turn LSIDs into a clickable
link guaranteed to work forever?<br>
  <br>
Rich's vision:<br>
  <a moz-do-not-send="true" href="http://%3Csome">http://&lt;some</a>
proxy server&gt;.org/?urn:lsid:zoobank.org:act:1234<br>
  <br>
This sounds to me like a question more about networking infrastructure,<br>
than TDWG's charter about data exchange protocols and content standards.<br>
I have always presumed that TDWG's standards would work using whatever<br>
networking infrastructure was available to them - e.g. DNS, HTTP, local<br>
provider servers, etc.  <br>
  <br>
But, then lsid.tdwg.org was created--a server. Servers are operational<br>
infrastructure.  I don't think TDWG has (yet) a "forever" funding stream<br>
to enable operational infrastructure - ongoing operation of server room,<br>
system administrator, network connections.  But, something like<br>
lsid.tdwg.org would serve a valuable purpose as Rich notes of enabling<br>
LSIDs as a clickable link in publications or other online sources.<br>
  <br>
Is there an existing international body that could operate a forever<br>
functioning LSID proxy (say like, proxy.lsid.org--which unfortunately is<br>
already lost to Lindsay-Strathmore Irrigation District)?<br>
  <br>
Maybe we will be forced to accept that there is no "forever" on the<br>
Internet and accept instead the "forseeable future".  I would think for<br>
the forseeable future that GBIF would be a good place to put a new LSID<br>
infrastructure like this since they are in the "operations center"<br>
business already and TDWG is by charter not. So, maybe the proxy should<br>
be lsid.gbif.org?<br>
  <br>
Chuck<br>
  <br>
  <br>
-----Original Message-----<br>
From: <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:tdwg-guid-bounces@lists.tdwg.org">tdwg-guid-bounces@lists.tdwg.org</a><br>
[<a moz-do-not-send="true"
 href="mailto:tdwg-guid-bounces@lists.tdwg.org%5D">mailto:tdwg-guid-bounces@lists.tdwg.org]</a>
On Behalf Of Richard Pyle<br>
Sent: Friday, November 30, 2007 6:39 AM<br>
To: 'Roger Hyam'; 'Roderic Page'<br>
Cc: <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:tdwg-guid@lists.tdwg.org">tdwg-guid@lists.tdwg.org</a><br>
Subject: [tdwg-guid] Embedding LSID links within Publications<br>
  <br>
  <br>
Thank you, Roger, for launching the next conversation I wanted to start<br>
on<br>
this list (not to interrupt the previous conversation....but this one is<br>
actually more pressing for me right now): <br>
  <br>
&gt; Would it be better to take the approach we have with LSIDs <br>
&gt; where we always cite a proxied version?<br>
&gt; <br>
&gt; What do other people do?<br>
  <br>
As many of you already know, I'm planning to publish the description of<br>
five<br>
new species of Chromis in Zootaxa on Jan 1 to:<br>
  <br>
- launch ZooBank<br>
- Commemorate the 250th Anniversary of the start of Zoological<br>
Nomenclature<br>
- Create an "exemplar" cybertaxonomy publication<br>
  <br>
I was talking this up at Bratislava, and things are still on track.<br>
Anyone<br>
who wants to know more about the project, let me know and I'll send a<br>
document describing it in more detail.<br>
  <br>
For now, I'll just provide a basic synopsis: This publication will<br>
include<br>
the first 5 zoological names proactively registered in ZooBank. As such,<br>
there will be five ZooBank LSIDs, which I will want to include within<br>
the<br>
publication itself (published in both paper version to comply with ICZN<br>
Code<br>
rules; and as an online PDF version, which 99.9% of people will actually<br>
read).  The plan is to have the PDF version marked up as much as<br>
possible,<br>
with taXMLit &amp; TaxonX markup files, SDD files for the character
data,<br>
ZooBank LSIDs, Images deposited in MorphBank, links to GenBank records<br>
for<br>
Barcode sequences, links to Museum specimen databases, links to BHL for<br>
literature cited, etc., etc.<br>
  <br>
So....this will be a document intended to show what could be possible<br>
with<br>
all this TDWG stuff we've all be working on for all these years -- i.e.,<br>
how<br>
cybertaxonomy could/should be done in the age of the internet.<br>
  <br>
Now, the PDF file itself will be rather simple -- a standard PDF file as<br>
per<br>
normal Zootaxa practice -- except in this document, there will be MANY<br>
embedded links that allow point-and-click access to all sorts of online<br>
resources -- each of which will in some way showcase TDWG and TDWG-like<br>
standards.<br>
  <br>
A bunch of these links will be LSIDs (e.g., ZooBank LSIDs, plus maybe<br>
others).  However, some of them may be other links (DOIs, URLs, etc.).<br>
All<br>
HTTP and other self-resolving links will be pretty straightforward, but<br>
I'm<br>
not sure yet how to embed links associated with the LSIDs.<br>
  <br>
Obviously, LSIDs are not, by themselves, completely self-resolving via<br>
most<br>
web browsers, so simply embedding the LSID as a link will not do the<br>
average<br>
user much good.  Thus, I'm now thinking of how I can make the LSIDs<br>
"clickable" from the PDF, to allow the cicker/user to be directed to<br>
something meangiful.  And that has caused me to think a lot about HTTP<br>
proxies for LSIDs.<br>
  <br>
Thus, assuming I have a ZooBank LSID that is<br>
urn:lsid:zoobank.org:act:1234,<br>
how do I represent that as a "clickable" link?  One way to do this would<br>
be<br>
to embed the LSID within the TDWG HTTP proxy:<br>
  <br>
  <a moz-do-not-send="true"
 href="http://lsid.tdwg.org/?urn:lsid:zoobank.org:act:1234">http://lsid.tdwg.org/?urn:lsid:zoobank.org:act:1234</a><br>
  <br>
However, what I'm shooting for is to have a document that can, as best<br>
as<br>
possible, withstand the test of time, such that 250 years from now, some<br>
or<br>
all of those embedded links will still work (I know, I know -- they<br>
won't --<br>
but humor me....) I'm a little neverous about simply assuming that the<br>
TDWG<br>
LSID resolver will still be around in 250 years.  Besides, 99.9% of<br>
users<br>
will look at the returned RDF and scratch their heads.<br>
  <br>
My gut feeling is that LSIDs have a better chance of surviving the<br>
long-term<br>
than URLs do.  And following this premise, the LSID<br>
"urn:lsid:zoobank.org:act:1234" will only survive as long as the<br>
authority<br>
"zoobank.org" survives (in theory), so it seems to me a slightly more<br>
appropriate solution would be to build a custom LSID resolver at<br>
zoobank.org, and thereby format the clickable link as:<br>
  <br>
  <a moz-do-not-send="true"
 href="http://zoobank.org/?lsid=urn:lsid:zoobank.org:act:1234">http://zoobank.org/?lsid=urn:lsid:zoobank.org:act:1234</a><br>
  <br>
Does this make sense to anyone?  Am I missing something fundamental<br>
here?<br>
Is there a better way to embed clickable links to LSIDs in a PDF<br>
document?<br>
  <br>
I have a bunch of other questions to follow up with, but let's tackle<br>
this<br>
one first.<br>
  <br>
Many thanks!!<br>
  <br>
Aloha,<br>
Rich<br>
  <br>
Richard L. Pyle, PhD<br>
Database Coordinator for Natural Sciences<br>
  and Associate Zoologist in Ichthyology<br>
Department of Natural Sciences, Bishop Museum<br>
1525 Bernice St., Honolulu, HI 96817<br>
Ph: (808)848-4115, Fax: (808)847-8252<br>
email: <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:deepreef@bishopmuseum.org">deepreef@bishopmuseum.org</a><br>
  <a moz-do-not-send="true"
 href="http://hbs.bishopmuseum.org/staff/pylerichard.html">http://hbs.bishopmuseum.org/staff/pylerichard.html</a><br>
  <br>
  <br>
  <br>
_______________________________________________<br>
tdwg-guid mailing list<br>
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:tdwg-guid@lists.tdwg.org">tdwg-guid@lists.tdwg.org</a><br>
  <a moz-do-not-send="true"
 href="http://lists.tdwg.org/mailman/listinfo/tdwg-guid">http://lists.tdwg.org/mailman/listinfo/tdwg-guid</a><br>
_______________________________________________<br>
tdwg-guid mailing list<br>
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:tdwg-guid@lists.tdwg.org">tdwg-guid@lists.tdwg.org</a><br>
  <a moz-do-not-send="true"
 href="http://lists.tdwg.org/mailman/listinfo/tdwg-guid">http://lists.tdwg.org/mailman/listinfo/tdwg-guid</a><br>
  </div>
  <pre wrap="">
<hr size="4" width="90%">
_______________________________________________
tdwg-guid mailing list
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:tdwg-guid@lists.tdwg.org">tdwg-guid@lists.tdwg.org</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://lists.tdwg.org/mailman/listinfo/tdwg-guid">http://lists.tdwg.org/mailman/listinfo/tdwg-guid</a>
  </pre>
</blockquote>
</body>
</html>