<html><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">NESCent Phyloinformatics VoCamp<br><br>OPEN CALL FOR PARTICIPATION<br><br>Integrating diverse biological data with the historical process of evolution<br>is a grand challenge for 21st century biology. The interoperability of data<br>from diverse fields (e.g., genetics, ecology, biodiversity, biomedicine)<br>requires a technology infrastructure based on formalized, shared<br>vocabularies. &nbsp;Developing such vocabularies is a community project. &nbsp;In<br>order to build controlled vocabularies and ontologies, the National<br>Evolutionary Synthesis Center (NESCent:&nbsp;<a href="http://nescent.org/">http://nescent.org</a>) is sponsoring a<br>"Phyloinformatics VoCamp".<br><br>We invite scientists from diverse sub-disciplines to apply for this event,<br>as explained below. The application deadline is September 18, 2009. More<br>information about motivation, plans, and preliminary ideas is available<br>online at&nbsp;<a href="http://bit.ly/VoCamp_Proposal">http://bit.ly/VoCamp_Proposal</a>. &nbsp;Feel free to disseminate this<br>notice to colleagues who may be interested.*<br><br>A VoCamp (<a href="http://vocamp.org/">http://vocamp.org</a>) is an intense, hands-on, working meeting with<br>face-to-face interactions between a diverse group of people focused on<br>vocabulary and ontology design, development and application. &nbsp;The<br>Phyloinformatics VoCamp will include ontology and vocabulary developers from<br>relevant efforts, experts on knowledge representation and reasoning, and<br>users and developers of integrative applications that use these ontologies.<br><br>This event will partially overlap with the Biodiversity Information<br>Standards (TDWG:&nbsp;<a href="http://tdwg.org/">http://tdwg.org</a>) Annual Conference in Montpellier, France,<br>November 9-13, 2009. &nbsp;The VoCamp is an activity of the TDWG Interest Group<br>on Phylogenetics Standards (<a href="http://wiki.tdwg.org/Phylogenetics">http://wiki.tdwg.org/Phylogenetics</a>) and is<br>partly supported by TDWG and the Université Montpellier.<br><br>GOALS AND ACTIVITIES<br>--------------------<br>The objective of the event is to connect previously disparate ontology<br>development efforts, stakeholder communities, and interoperability<br>initiatives with shared objectives. Aside from sharing knowledge, expertise,<br>and best practices, our goal is to build-out existing ontology resources in<br>a hands-on manner in terms of ontological rigor, semantic richness, and<br>modularity that supports effective reuse.<br><br>We also plan to have programming expertise and activities present at the<br>event, such as for necessary large-scale transformations, and especially for<br>proof-of-concept applications that directly apply the ontologies being<br>developed.<br><br>On a long-term basis, we anticipate that the event, if successful, will give<br>rise to similarly structured follow-up events organized by the participating<br>stakeholder communities, such as TDWG, SONet<br>(<a href="http://sonet.ecoinformatics.org/">http://sonet.ecoinformatics.org</a>), and OBO (<a href="http://www.obofoundry.org/">http://www.obofoundry.org</a>).<br><br><br>ORGANIZATION<br>------------<br>The VoCamp will be 4 days in duration during November 7-11, 2009 and is<br>co-located with the TDWG annual conference<br>(<a href="http://www.tdwg.org/conference2009">http://www.tdwg.org/conference2009</a>) in Montpellier, France. &nbsp;The first two<br>days (Nov 7-8) will be dedicated entirely to VoCamp and the remainder of the<br>event (Nov 10-11) will overlap with TDWG 'workshops days'. &nbsp;Participants<br>will have the opportunity, and are encouraged, to interact with TDWG<br>participants and attend conference sessions outside of the VoCamp.<br><br>The specific vocabulary development targets will be selected by the<br>participants partly in advance through a dedicated area on a wiki, a mailing<br>list, and one or more conference calls, and partly on-site through an Open<br>Space activity. The exact agenda for the event will be developed similarly,<br>but will be largely devoted to ontology and vocabulary development time. At<br>the event itself, participants will self-organize into small subgroups<br>focused on particular targets. The VoCamp will conclude with a wrap-up<br>session, and a report presented to the TDWG conference audience.<br><br>We also anticipate that several "boot camps" will be needed to ensure a<br>productive event for all participants, for example on ontology design and<br>engineering, reasoning, and infrastructure for collaborative development of<br>ontologies.<br><br>We welcome comments and suggestions for issues in ontology development that<br>are not explicitly addressed here or in our proposal but that could be<br>addressed at the event. Please email the organizers at&nbsp;<a href="mailto:vocamp1@nescent.org">vocamp1@nescent.org</a><br>with any suggestions.<br><br><br>HOW TO APPLY<br>------------<br>The application consists of your cv and your responses to 6 questions about<br>your experience, skills, objectives, support, and commitment to open<br>software development. To apply, please fill out the online form at<br><a href="http://bit.ly/VoCamp_Form">http://bit.ly/VoCamp_Form</a>&nbsp;by September 18, and submit your CV &nbsp;to the<br>organizers at&nbsp;<a href="mailto:vocamp1@nescent.org">vocamp1@nescent.org</a>. NESCent will provide funds in support of<br>expenses, including travel, accommodation, registration, and meals. Pending<br>the final amount of funds available and the support requested by the<br>participants, sponsorship may need to be capped. &nbsp;<br>Logistical and travel details will be communicated to accepted and confirmed<br>participants.<br><br>We specifically encourage applications from members of under- represented<br>groups, specifically women and minorities, and from graduate students and<br>post-docs. &nbsp;If you have questions or are unsure whether to apply, please<br>contact an organizer or write to&nbsp;<a href="mailto:vocamp1@nescent.org">vocamp1@nescent.org</a>&nbsp;.<br><br>Please understand that funding and space for this event are limited. &nbsp;<br>We also need to balance a critical mass of expertise in specific areas with<br>broad participation. Therefore, not all qualified applicants can be<br>guaranteed acceptance.<br><br>Yours,<br><br>The Organizing Committee<br><br>&nbsp;Arlin Stoltzfus, Chair (University of Maryland Biotechnology Institute)&nbsp;<br>&nbsp;Nico Cellinese (University of Florida)&nbsp;<br>&nbsp;Karen Cranston (Field Museum of Natural History)&nbsp;<br>&nbsp;Hilmar Lapp (NESCent)&nbsp;<br>&nbsp;Sheldon McKay (Cold Spring Harbor Laboratory, iPlant Collaborative)&nbsp;<br>&nbsp;Enrico Pontelli (New Mexico State University)<br><br><br>* This announcement is being sent to the following lists: evoldir, TDWG,<br>SSB, nexml, phylows, CDAO, SONet, GBIF, Ecolog, TAXACOM.<br><br></body></html>