<HTML><BODY style="word-wrap: break-word; -khtml-nbsp-mode: space; -khtml-line-break: after-white-space; ">Here is a comment from Donald,<DIV><BR class="khtml-block-placeholder"></DIV><DIV>I have to say I have no idea why this statement is on the report... was like this in the previous too no?</DIV><DIV><BR class="khtml-block-placeholder"></DIV><DIV>Cheers.<BR><DIV><BR><DIV>Begin forwarded message:</DIV><BR class="Apple-interchange-newline"><BLOCKQUOTE type="cite"><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><FONT face="Helvetica" size="3" color="#000000" style="font: 12.0px Helvetica; color: #000000"><B>From: </B></FONT><FONT face="Helvetica" size="3" style="font: 12.0px Helvetica">Donald Hobern &lt;<A href="mailto:dhobern@gbif.org">dhobern@gbif.org</A>&gt;</FONT></DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><FONT face="Helvetica" size="3" color="#000000" style="font: 12.0px Helvetica; color: #000000"><B>Date: </B></FONT><FONT face="Helvetica" size="3" style="font: 12.0px Helvetica">27 de junio de 2007 12:17:27 GMT+02:00</FONT></DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><FONT face="Helvetica" size="3" color="#000000" style="font: 12.0px Helvetica; color: #000000"><B>To: </B></FONT><FONT face="Helvetica" size="3" style="font: 12.0px Helvetica">Javier de la Torre &lt;<A href="mailto:jatorre@gmail.com">jatorre@gmail.com</A>&gt;</FONT></DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><FONT face="Helvetica" size="3" color="#000000" style="font: 12.0px Helvetica; color: #000000"><B>Subject: </B></FONT><FONT face="Helvetica" size="3" style="font: 12.0px Helvetica"><B>Re: [Biogeosdi] Re: Search on the GBIF REST services</B></FONT></DIV><DIV style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; min-height: 14px; "><BR></DIV>   Thanks, Javier.<BR> <BR> I'll take a look.  By the way, the report says:<BR> <BR> */ GBIF data does not reference the original data providers<BR> <BR> Are you having a problem with this?  Every occurrence record (and every taxon concept) is nested within a DataResource metadata block, which is itself nested within a DataProvider block.  For each you can use the appropriate web service (with the supplied key values) to retrieve full information (including access points for DataResources).<BR> <BR> If you need help, please let me know.<BR> <BR> Many thanks,<BR> <BR> Donald<BR> <BR> Javier de la Torre wrote: <BLOCKQUOTE cite="mid:30A98D46-9BF0-4A5D-86B9-F1A8767BA277@gmail.com" type="cite">jaja.  <BR>  <BR> Well,  <BR>  <BR> Let me send you the report as it is today. The doxygen still looks very bad, maybe is easier for you to just try the service interface we have for the code:  <BR>  <BR> <A class="moz-txt-link-freetext" href="http://omtest.cria.org.br/biogeosdi/backend/libs/amfphp/browser/">http://omtest.cria.org.br/biogeosdi/backend/libs/amfphp/browser/</A>  <BR>  <BR> The doxygen is here (we are working to clean it):  <BR>  <BR> <A class="moz-txt-link-freetext" href="http://omtest.cria.org.br/biogeosdi/doc/html/">http://omtest.cria.org.br/biogeosdi/doc/html/</A>  <BR>  <BR> The two prototypes themselves can be found at:  <BR>  <BR> <A class="moz-txt-link-freetext" href="http://omtest.cria.org.br/biogeosdi/doc/html/">http://omtest.cria.org.br/biogeosdi/doc/html/</A>  <BR>  <BR>  <BR> Have fun.  <BR>  <BR> Javier.  <BR>  <BR>  <PRE wrap=""><HR size="4" width="90%">


On 27/06/2007, at 10:36, Donald Hobern wrote:



<BLOCKQUOTE type="cite">Do you have any current presentation/document outlining what you are doing in BioGeoSDI?  A web search tells me that you have exceptionally well commented code...



Donald



Javier de la Torre wrote:

<BLOCKQUOTE type="cite">Buff... that is more than enough!!

I suppose you also drop latitude=longitude=0 right?



I think we have to change our report on this topic jeje.



Cheers.



On 26/06/2007, at 22:13, Donald Hobern wrote:



<BLOCKQUOTE type="cite">Right now the dodginess is only detected for records where we interpret the Country name as a particular country and also have coordinates and the coordinates do not intersect the country.  In many cases we actually also determine that the latitude is negated, the longitude is negated and/or the latitude and longitude are transposed.



Donald



Tim Sutton wrote:

<BLOCKQUOTE type="cite">Hi



Great stuff that we can now exclude dodgy / non existant occurrences -

we could probably make th e second (coordinate issues) option user

settable (or at the least a setting in our global config file).



Regards



Tim



2007/6/26, Javier de la Torre <A class="moz-txt-link-rfc2396E" href="mailto:jatorre@gmail.com">&lt;jatorre@gmail.com&gt;</A>:

<BLOCKQUOTE type="cite">Great,



I will then uncomment the code :)



Javier.



On 26/06/2007, at 17:24, Donald Hobern wrote:



&gt; Thanks, Javier - found the problem - will get the fix deployed

&gt; tomorrow.

&gt;

&gt; Best wishes,

&gt;

&gt; Donald

&gt;

&gt; Javier de la Torre wrote:

&gt;&gt; Great Donald,

&gt;&gt;

&gt;&gt; We have now some comments to remove on the report about the GBIF

&gt;&gt; REST service ;)

&gt;&gt;

&gt;&gt; Still I have an issue when using the &amp;coordinateissues=false

&gt;&gt; parameter

&gt;&gt;

&gt;&gt; This URL returns 195 records:

&gt;&gt; <A class="moz-txt-link-freetext" href="http://data.gbif.org/ws/rest/occurrence/list">http://data.gbif.org/ws/rest/occurrence/list</A>?

&gt;&gt; format=brief&amp;scientificname=Puma+concolor

&gt;&gt;

&gt;&gt; This one none:

&gt;&gt; <A class="moz-txt-link-freetext" href="http://data.gbif.org/ws/rest/occurrence/list">http://data.gbif.org/ws/rest/occurrence/list</A>?

&gt;&gt; format=brief&amp;coordinateissues=false&amp;scientificname=Puma+concolor

&gt;&gt;

&gt;&gt;

&gt;&gt; And I suppose not all coordinates are wrong no?

&gt;&gt;

&gt;&gt; Cheers.

&gt;&gt;

&gt;&gt;

&gt;&gt; On 26/06/2007, at 14:29, Donald Hobern wrote:

&gt;&gt;

&gt;&gt;&gt; Dear Javier,

&gt;&gt;&gt;

&gt;&gt;&gt; The structures are now stable.  Sorry not to have copied you on

&gt;&gt;&gt; my emails on what was changing.  Adding "&amp;coordinatestatus=true"

&gt;&gt;&gt; should limit responses to those with coordinates.  You can also

&gt;&gt;&gt; use "&amp;coordinateissues=false" to exclude records where we have

&gt;&gt;&gt; detected that the coordinates do not match the supplied country

&gt;&gt;&gt; name.

&gt;&gt;&gt;

&gt;&gt;&gt; Donald

&gt;&gt;&gt;

&gt;&gt;&gt; Javier de la Torre wrote:

&gt;&gt;&gt;&gt; Hey Donald,

&gt;&gt;&gt;&gt;

&gt;&gt;&gt;&gt; I am fixing some stuff on the prototype we did in Brasil and I

&gt;&gt;&gt;&gt; had to change my code to reflect the new format that the rest

&gt;&gt;&gt;&gt; services are sending now. Is this more or less stable now?

&gt;&gt;&gt;&gt;

&gt;&gt;&gt;&gt; And another question, would be possible to ask the service to

&gt;&gt;&gt;&gt; return only occurrences with coordinates. For us is not of much

&gt;&gt;&gt;&gt; use occurrences without coordinates.

&gt;&gt;&gt;&gt;

&gt;&gt;&gt;&gt; Thats the query I am trying

&gt;&gt;&gt;&gt;

&gt;&gt;&gt;&gt; <A class="moz-txt-link-freetext" href="http://newportal.gbif.org/ws/rest/occurrence/list">http://newportal.gbif.org/ws/rest/occurrence/list</A>?

&gt;&gt;&gt;&gt; format=brief&amp;minLatitude=-90&amp;maxLatitude=90&amp;scientificname=Puma

&gt;&gt;&gt;&gt; +concolor

&gt;&gt;&gt;&gt;

&gt;&gt;&gt;&gt; Thanks in advance.

&gt;&gt;&gt;&gt;

&gt;&gt;&gt;&gt; Javier.

&gt;&gt;&gt;&gt;

&gt;&gt;&gt;&gt;

&gt;&gt;&gt;&gt;

&gt;&gt;&gt;

&gt;&gt;&gt; --

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&gt;&gt;&gt; Donald Hobern (<A class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:dhobern@gbif.org">dhobern@gbif.org</A>)

&gt;&gt;&gt; Deputy Director for Informatics Global Biodiversity Information

&gt;&gt;&gt; Facility Secretariat Universitetsparken 15, DK-2100 Copenhagen,

&gt;&gt;&gt; Denmark

&gt;&gt;&gt; Tel: +45-35321483   Mobile: +45-28751483   Fax: +45-35321480

&gt;&gt;&gt; ------------------------------------------------------------

&gt;&gt;&gt;

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